Der Wert einer Muschelperle wird stark von ihrer Herkunft beeinflusst. Natürliche Perlen, die ohne menschliches Eingreifen entstanden sind, sind selten und daher oft teurer. Gezüchtete Perlen, die in kontrollierten Umgebungen wachsen, sind zwar häufiger, können aber aufgrund ihrer Qualität ebenfalls hohe Preise erzielen. Die Art der Muschel, aus der die Perle stammt, spielt ebenfalls eine Rolle. Einige Muschelarten sind bekannter für die Produktion hochwertiger Perlen.